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한국산 꿩의다리속(미나리아재비과)의 cpDNA trnL-F 지역의 분자진화와 유연관계: Indel events의 영향
박성준, 김혁진, 박선주, Park. Seongjun, Kim. Hyuk-Jin, Park. SeonJoo 한국식물분류학회 식물분류학회지 11 Pages
한국식물분류학회 식물분류학회지 2012, Vol.42 No.1 13-23 (11 pages)
본 연구는 한국산 꿩의다리속 내에서 trnL-F 지역의 분자진화와 유연관계를 분석하였다. 갭형질을 이용한 자료의 베이시안과 파시모니 분석에서 몇몇 indels evolution는 분계조를 지지하여 해상력이 좋은 계통수가 나타났다. 한국산 꿩의다리속 내에 cpDNA trnL-F 지역의 indel events는 계통학적으로 유용한 정보를 가지고 있는 것으로 판단된다. 산꿩의다리절(그늘꿩의다리 제외)은 속내에서 가장 먼저 분기한 것으로 나타났고, 나머지 절은 강하게 분계조를 형성하며 분기하였다. 한국산 꿩의다리속 내에 trnL-F 지역은 뉴클레오티드의... -
제주 흑우 집단에서 Indel, Microsatellite 마커와 MC1R 유전자형을 이용한 친자 확인
한상현, 조상래, 조인철, 조원모, 김상금, 양성년, 강용준, 박용상, 김영훈, 박세필, 김은영, 이성수, 고문석, Han. Sang Hyun, Cho. Sang-Rae, Cho. In-Cheol, Cho. Won-Mo, Kim. Sang-Geum, Yang. 한국수정란이식학회 韓國受精卵移植學會誌 7 Pages
한국수정란이식학회 韓國受精卵移植學會誌 2013, Vol.28 No.3 207-213 (7 pages)
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제주흑우, 한우 및 수입 소 품종에서 새로운 indel 마커의 다형성과 대립인자 분포
한상현, 김재환, 조인철, 조상래, 조원모, 김상금, 김유경, 강용준, 박용상, 김영훈, 박세필, 김은영, 이성수, 고문석, Han. Sang-Hyun, Kim. Jae-Hwan, Cho. In-Cheol, Cho. Sang-Rae, Cho. Won-Mo, Kim 한국생명과학회 생명과학회지 7 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2012, Vol.22 No.12 1644-1650 (7 pages)
이용한 소 6 품종은 8 종의 marker들에 대해 다형성을 나타내었으나, Indel_15의 경우 Holstein과 Charolais에서 다형성이 발견되지 않았다. JBC 집단에 대한 분석에서는 관찰된 이형접합자 빈도는 HW_G1 (0.600)에서 가장 높고, Indel_29 (0.274)에서 가장 낮았다. Marker에 대한 다형정보량의 수준은 HW_G4 (0.373)에서 가장 높고, Indel_6 (0.305)에서 가장 낮은 수준을 보였다. 본 연구에서 조사한 새로운 indel marker들은 특히 제주흑우 집단의 생산성 향상을 위한 분자육종 체계의 개발뿐만 아니라 친자확인이나 생산이력추적을... -
Epidemiologic and phylogenetic analysis of the isolated porcine reproductive and respiratory syndrome virus in local swine farms of Korea
Hyeon-jeong Kang, Ji Eun Yu, In Ohk Ouh, Ji Eun Shin, Seung Min Song, In Soo Cho, Sang Ho Cha 대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 2 Pages
대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 추계학술심포지움 103 241-242 (2 pages)
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Determination of SNP primers for genotyping by whole-genome sequence of Mycobacterium bovis strain B-3222 isolated from Korean beef cattle in bTB-infected herd
Yu Sin Ok, Narae Kim, Tae woon Kim, Yunho Jang, Shin Seok Kang, Hyeon Seop Byeon, Suk Chan Jung, Young Hee Lim, Jae Myung Kim 대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 2 Pages
대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 추계학술심포지움 102 240-241 (2 pages)
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Sequence variations of the bovine prion protein gene (PRNP) in native Korean Hanwoo cattle
Sangho Choi, Hee-Jong Woo*, Jeongmin Lee* 대한수의학회 Journal of Veterinary Science 11 Pages
대한수의학회 Journal of Veterinary Science 2012, 제 13권 제 2호 3 127-137 (11 pages)
were completely conserved, and the haplotype frequency of the coding region was similar to that of other B. taurus strains. When we examined the 23-bp and 12-bp insertion/deletion (indel) polymorphisms in the non-coding region of PRNP, Hanwoo cattle had a lower deletion allele and 23-bp del/12-bp del haplotype frequency than healthy and BSE-affected animals of other strains. Thus, Hanwoo are seemingly less susceptible to BSE than other strains due to the 23-bp and 12-bp indel polymorphisms. -
Resistance to Turnip Mosaic Virus in the Family Brassicaceae
Peter Palukaitis, Su Kim 한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 23 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2021, 37권 1호 1 1-23 (23 pages)
Resistance to diseases caused by turnip mosaic virus (TuMV) in crop species of the family Brassicaceae has been studied extensively, especially in members of the genus Brassica. The variation in response observed on resistant and susceptible plants inoculated with different isolates of TuMV is due to a combination of the variation in the plant resistome and the variation in the virus genome. Here, we review the breadth of this variation, both at the level of variation in TuMV sequences, with one... -
De novo Genome Assembly and Single Nucleotide Variations for Soybean Mosaic Virus Using Soybean Seed Transcriptome Data
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 10 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2017, 33권 5호 5 478-487 (10 pages)
Soybean is the most important legume crop in the world. Several diseases in soybean lead to serious yield losses in major soybean-producing countries. Moreover, soybean can be infected by diverse viruses. Recently, we carried out a large-scale screening to identify viruses infecting soybean using available soybean transcriptome data. Of the screened transcriptomes, a soybean transcriptome for soybean seed development analysis contains several virus-associated sequences. In this study, we... -
Molecular Screening of Blast Resistance Genes in Rice using SSR Markers
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 13 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2015, 31권 1호 2 12-24 (13 pages)
Rice Blast is the most devastating disease causing major yield losses in every year worldwide. It had been proved that using resistant rice varieties would be the most effective way to control this disease. Molecular screening and genetic diversities of major rice blast resistance genes were determined in 192 rice germplasm accessions using simple sequence repeat (SSR) markers. The genetic frequencies of the 10 major rice blast resistance genes varied from 19.79% to 54.69%. Seven accessions... -
Mini-Review : Current Insights into Research on Rice stripe virus
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 11 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2013, 29권 3호 1 223-233 (11 pages)
Rice stripe virus (RSV) is one of the most destructive viruses of rice, and greatly reduces rice production in China, Japan, and Korea, where mostly japonica cultivars of rice are grown. RSV is transmitted by the small brown plant-hopper (SBPH) in a persistent and circulative-propagative manner. Several methods have been developed for detection of RSV, which is composed of four single-stranded RNAs that encode seven proteins. Genome sequence data and comparative phylogenetic analysis have been... -
Screening of Rice Blast Resistance Genes from Aromatic Rice Germplasms with SNP Markers
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 10 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2010, 26권 1호 10 70-79 (10 pages)
Rice blast is one of the serious devastating diseases. This study was carried out to determine the genetic diversities of blast resistance (R) genes form 86 accessions of aromatic rice with eight SNP markers, z4792, zt4792, z60510, zt6057, k6415, k6411, k39575 and t256, which showed the close-set linkage to 6 major genes, Piz, Piz-t, Pik, Pik-m, Pik-p, and Pit. Four accessions of indica type, Mayataung, Yekywin Yinkya Hmwe, Basmati9-93, and Basmati5854, showed the positive amplicons of six major... -
바이러스 열성 저항성: 병저항성 작물 개발을 위한 유전자 교정 소재 발굴 연구의 동향
한수정, 허경재, 최보람, 서장균 한국식물병리학회 식물병연구 13 Pages
한국식물병리학회 식물병연구 2019, 25권 2호 1 49-61 (13 pages)
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뿌리혹병 및 시들음병에 대한 저항성 양배추와 브로콜리 유전자원 탐색
이지현 · 조은주 · 장경수 · 최용호 · 김진철 · 최경자* 한국식물병리학회 식물병연구 10 Pages
한국식물병리학회 식물병연구 2014, 20권 4호 1 235-244 (10 pages)
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정서불안정 아동의 놀이치료 사례 연구
한국인간발달학회 인간발달연구 2007, 제 14권 제 2호 4 71-92 (22 pages)
본 연구는 정서불안정 아동에게 40회기의 아동 중심 놀이치료를 적용한 사례이다. 아동의 놀이치료 과정을 분석하고, 치료실에서의 변화가 일상생활에서 어떤 변화를 가져왔는지 어머니의 면담을 토대로 분석하였다. 놀이치료동안 아동은 치료자와의 신뢰관계 속에서 감정이완을 거쳐 불안과 공격성을 표출하며 감정정화를 경험하였다. 나아가 긍정적 자아를 통합하면서 상담초기의 주 호소 문제를 해결하게 되었다. 치료자는 놀이치료 초기에 아동중심의 입장에서 내담 아동의 정서를 이완시킬 수 있도록 하는데 주력하였으며, 이후에는... -
Phylogenetic Relationships of the Genus Hemerocallis in Korea using rps16-trnK Sequences in Chloroplast DNA
허만규, 권오성, 이병룡, Huh. Man Kyu, Kwon. Oh Sung, Lee. Byeong Ryong 한국생명과학회 생명과학회지 7 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2013, Vol.23 No.7 847-853 (7 pages)
엽록체의 rps16-trnK 부위로 계통관계를 평가하였다. 배당된 서열은 원추리(H. aurantiaca)에서 729 핵산 수로 가장 적었으며 왕원추리(H. fulva var. kwanso)에서 742 핵산 수로 가장 많았다. 그 차이는 염기 삽입에 기인하였다. 비록 일부 인델(indel)과 20개 염기의 삽입이 발견되었지만 서열 내 변이는 염기 치환이 많았다. rps16 - trnK에 의한 한국내 원추리속 분류군들은 높은 지지도로 잘 분리되었다. 애기원추리(H. minor)와 홍도원추리(H. littorea)는 높은 지지도로 같은 분지군을 형성하였으며 이 분지군은 노랑원원추리와... -
Phylogeny Study of Genus Pelvetia in Korea by Internal Transcribed Spacer Sequence (ITS)
이복규, 허만규, 최주수, 조성현, Lee. Bok-Kyu, Huh. Man-Kyu, Choi. Joo-Soo, Cho. Sung-Hyun 한국생명과학회 생명과학회지 6 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2009, Vol.19 No.3 311-316 (6 pages)
Pelvetia 속 내 여러 종간은 결실이나 삽입에 의한 indel이 많은 반면 같은 종내 계통은 치환에 의한 차이가 현저하였다. 이 속은 NJ분석에서 크게 두 분지군으로 나뉘는데 한 그룹은 P. canaliculata와 P. limitata이며 나머지 그룹은 P. siliquosa, P. compressa, P. babingtonii을 포함하고 있었다. ITS 서열로 한국 내 분류군과 북미 간 분류군이 잘 구분되었다. MP 분석에서도 높은 지지도로 잘 구분되었다. 따라서 ITS 서열로 종 동정에 이용할 수 있었으며, 종의 보전이나 생식질 보전에 기초로 이용될 수 있을 것으로 사료된다. -
Identification of SNPs in Highly Variable Lysozyme Gene in Korean Native Chicken Populations
라세둘, 강보석, 임희경, 최강덕, 이준헌, Hoque. M.R., Kang. B.S., Lim. H.K., Choi. K.D., Lee. J.H. 충남대학교 농업과학연구소 농업과학연구 6 Pages
충남대학교 농업과학연구소 농업과학연구 2010, Vol.37 No.3 399-404 (6 pages)
닭의 진화를 이해하기 위하여 변이가 많다고 알려진 LYZ 유전자의 엑손과 인트론에 존재하는 단일염기다형이 본 연구를 통해 확인되었다. 2개의 한국 재래실용계에서 총 24개체의 DNA 샘플이 본 연구에서 이용되었으며 단일염기 다형의 확인을 위하여 3개체의 샘플을 혼합하여 염기서열 분석을 실시하였다. 적색야계와의 비교를 통하여 두 한국 재래실용계는 18개의 염기서열변이를 확인할 수 있었으며 한국 재래실용계 간에는 15개의 염기서열 변이를 확인할 수 있었다. 총 33개의 변이 중 두 개의 삽입변이(21 bp와 4 bp)가 확인되었다.... -
Next-Generation Sequencing-Based Genome-Wide Mutation Analysis of $small{L}$-Lysine-Producing Corynebacterium glutamicum ATCC 21300 Strain
Lee. Chang-Soo, Nam. Jae-Young, Son. Eun-Suk, Kwon. O-Chul, Han. Woorijarang, Cho. Jae-Yong, Park. Young-Jin 한국미생물학회 The journal of microbiology 4 Pages
한국미생물학회 The journal of microbiology 2012, Vol.50 No.5 860-863 (4 pages)
