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Phylogenetic and Taxonomic Status of the Phytoplasmas Associated with Water Dropwort(Oenanthe javanica DC) Disease in Korea and Japan
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 6 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2002, 18권 3호 1 109-114 (6 pages)
RFLP analysis using AluI, HaeIII, HhaI, KpnI, MseI, and RsaI restriction enzymes and by sequence analysis of the PCR products. The water dropwort witches` broom (WDWB) and water dropwort yellows (WDY) 16S rDNA sequences were identical and closely related to onion yellows (OY, 99.9% identity), which belong to the aster yellows (AY) 16S-subgroup. However, the KpnI RFLP analyses clearly distinguished the WDY and WDWB phytoplasmas from the OY phytoplasma. The phylogenetic analysis based on 16S rDNA... -
Identification of Luteovirus Nucleotide Sequences in Mild Yellow-Edge Diseased Strawberry Plants
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 5 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2002, 18권 1호 1 1-5 (5 pages)
reaction (PCR) products of a 487 bp. and approximately 500 bp DNA fragments were amplified from nucleic acid extracts of PLRV-infected tissue and strawberry mild yellow-edge (SMYE) diseased strawberry tissue, respectively. The amplified DNA fragments were further differentiated by hybridization analysis with a cDNA probe for the coat protein gene of PLRV and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. These results suggest that a luteovirus is associated with the SMYE disease. -
삽교호의 세균 다양성과 계통분류학적 분석
김명, 전은형, 안태영, Kim. Myeong, Jeon. Eun-Hyeong, An. Tae-Yeong 한국미생물학회 미생물학회지 5 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2003, Vol.39 No.4 272-276 (5 pages)
클론 라이브러리를 이용하여 RFLP (restriction fragment length polymorphism)를 분석하였으며, OTUs (operating taxonomy units)로 그룹화하였다. 측정된 종다양성 지수가 8월에 더 높게 나타났으며, 5월의 153개중 34개의 클론과 8월의 131개중 38개의 클론들을 염기서열 분석하였다. 그 결과 Proteobacteria, Cytophaga, Gram positive bacteria와 Verrucomicrobia가 5월과 8월에 공통적으로 분포하는 것으로 나타났으며, 특히 Planctomyces, 시안세균과 엽록체가 조류 대발생이 일어난 8월에 분포하는 것으로 조사되었다. 전반적인... -
16S rRNA 유전자 분석에 의한 전남 순천만 갯벌의 세균 다양성
이명숙, 홍순규, 이동훈, 배경숙 한국미생물학회 미생물학회지 8 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2001, Vol.37 No.2 137-144 (8 pages)
총 111개의 클론으로부터 HaeIII를 이용하여 amplified rDNA restriction analysis (ARDRA)를 수행하고, Gelcompar II 프로그램을 이용하여 pattern을 clustering하였다. 111개의 클론 중 100가지의 서로 다른 RFLP type이 조사되었고, 이들 중 전체 클론 라이브러리를 대표할 수 있는 20개의 클론을 선별하여 부분적인 염기서열을 분석하여 세균 다양성을 분석하였다. 20개의 클론중에는 RDP와 GenBank에서 제공하는 small subunit RNA database와 동일한 클론은 존재하지 않았으며, 이미 알려진 배양 가능한 세균의 16S rRNA 염기서열과... -
Pulsed-field Gel Electrophoresis를 이용한 Mycobacterium fortuitum의 유전형 분석
이태윤, 도인아, 김성광, Lee. Tae-Yoon, Do. In-A, Kim. Sung-Kwang 영남의대학술지편집위원회 영남의대 학술지 20 Pages
영남의대학술지편집위원회 영남의대 학술지 1995, Vol.12 No.2 366-385 (20 pages)
제한효소을 사용한 PFGE분석으로 유전형의 구분이 가능하였다. Cluster analysis를 시행한 결과 크게 두 집단으로 나뉘었던 M. fortuitum 균주들은 보다 복잡한 집단으로 분류되어 XbaI을 사용한 PFGE분석법이 M. fortuitum 균주분류를 위하여는 보다 적절함을 알 수 있었다. Cluster analysis에서 얻은 최대 % dissimilarity 값은 0.74(AsnI) 및 0.75(XbaI)로서 이 값은 arbitrarily primed polymerase chain reaction(AP-PCR)법보다는 높고 restriction fragment length polymorphism(RFLP) 법보다는 낮아 PFGE법이 RFLP를 보완하거나... -
TP53 Codon 72 Polymorphism and Risk of Acute Leukemia
Dunna. Nageswara Rao, Vure. Sugunakar, Sailaja. K., Surekha. D., Raghunadharao. D., Rajappa. Senthil, Vishnupriya. S. 아시아태평양암예방학회 Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP 4 Pages
아시아태평양암예방학회 Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP 2012, Vol.13 No.1 347-350 (4 pages)
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파라핀조직을 이용한 미토콘드리아 DNA 돌연변이 확인
김상호, 유석호 한국생명과학회 생명과학회지 5 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2004, Vol.14 No.2 296-300 (5 pages)
환자의 생조직, 얼린 조직 혹은 혈액이 없는 경우에, formalin으로 고정된 파라핀조직을 이용하여 미토콘드리아 돌연변이를 확인할 수 있는지를 조사하였다. MELAS 환자 4명의 파라핀조직을 택해 이들 조직으로부터 DNA를 추출하여 대부분의 MELAS 환자 미토콘드리아 DNA의 tRN $A^{Leu(UUR)}$ gene의 3243지역에서 발견되는 Adenine의 Cuanine으로의 염기치환을 확인하고자 하였다. 실험결과 3명의 환자에게서 이 점 돌연변이를 확인할 수 있어 이들 파라핀조직의 상태가 좋은 것으로 여겨져 미토콘드리아 DNA 돌연변이 연구에... -
미토콘드리아 DNA의 제한효소 분석법에 의한 영지의 계통분류
홍순규, 정학성, Hong. Soon-Gyu, Jung. Hack-Sung 한국미생물학회 미생물학회지 7 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 1994, Vol.32 No.4 245-251 (7 pages)
영지속(Ganoderma)에 속하는 7종 10균주에 대하여 미토콘드리아 DNA의 제한효소 분절양상 비교를 통한 계통분석을 수행하였다. 여러 가지 제한효소들 중 생산된 절편이 충분한 정보를 가지고 있으면서 서로 구별할 수 있는 6가지의 제한효소를 분석에 이용하였다. 절편양상을 설 비교하여 전체 절편중 공통된 절편의 개수를 구하고 이로부터 염기위치당 염기치환율을 구하였으며, 이를 균주간의 진화거리로 계산하여 PHYLIP package의 Neighbor-joining 방법에 이한 계통도를 얻고 그 결과를 고찰하였다. 특이한점은 G. lucidum의 3균주와... -
Molecular Identification of Predominant Bifidobacterium Strains Isolated from Korean Feces
So. Jae-Seong, Lee. Ki-Yong, Soo. Jea-Kal, Heo. Tae-Ryeon, Kim. Seung-Cheol 한국미생물생명공학회 Journal of microbiology and biotechnology 6 Pages
한국미생물생명공학회 Journal of microbiology and biotechnology 2002, Vol.12 No.1 176-181 (6 pages)


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