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- 자연 과학 논문집 : 배재대학 첨단과학연구소(1)
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Nested PCR과 DNA Enzyme-Linked Immunosorbent Assays를 이용한 Ralstonia solanacearum의 검출
고영진, 조홍범, Ko. Young-Jin, Cho. Hong-Bum 한국미생물학회 미생물학회지 7 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2007, Vol.43 No.3 179-185 (7 pages)
본 연구는 polymerase chanin reaction(PCR)기법과 DNA enzyme-linked immunosorbent assay(DNA ELISA) 기법을 이용하여 토양내 식물병원균인 Ralstonia solanacearum를 검출하고자 하였다. 토양 시료로부터 분석에 사용될 R. solanacearum DNA를 추출하기 위하여 몇 가지 방법을 비교 평가한 결과 기존의 DNA 추출 방법에 비하여 Guanidin isothiocyanate와 Chelex-100 resin을 사용하는 방법 이 토양 내에 존재하는 다양한 중류의 반응 저해 물질과 R. solanacearum만의 고유한 PCR반응 저해물질들을 제거하는 데에 효과적이었다. R.... -
바이러스 핵산중합효소의 아미노산 서열에 의한 바이러스 분류
남지현, 이동훈, 이건명, 이찬희, Nam. Ji-Hyun, Lee. Dong-Hun, Lee. Keon-Myung, Lee. Chan-Hee 한국미생물학회 미생물학회지 7 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2007, Vol.43 No.4 285-291 (7 pages)
볼티모어의 분류체계에 의하면 바이러스는 복제 및 단백질합성 전략에 따라 6개의 집단으로나눌 수 있다. 몇 종류의 작은 DNA 바이러스를 제외한 대부분의 바이러스는 게놈 복제를 위한 자신의 핵산중합효소를 유전자로 암호화하고 있다. 바이러스 핵산중합효소에는 DNA-의존DNA 중합효수, RNA-의존RNA 중합효소, RNA-의존 DNA 중합효소 세 종류가 있으며, 이들은 모두 4개의 공통된 모티프(motif)를 가진다. 우리는 볼티모어의 분류체계와 바이러스의 핵산중합효소와의 관계를 아미노산 서열을 통해 분자 계통분류학적 분석을 통해... -
새로운 저온 내성세균의 동정과 $eta-Galactosidase$ 생산
박정운, 유재수, 노동현, Park. Jeong-Woon, Yoo. Jae-Soo, Roh. Dong-Hyun 한국미생물학회 미생물학회지 7 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2006, Vol.42 No.1 40-46 (7 pages)
2% Escherichia coli로 동정되었다. Polymerase chain reaction으로 16S rRNA유전자를 증폭하여 1,426 bp의 염기서열을 결정하여 기존에 보고된 유전자들과의 유사도를 조사한 결과 분리된 균주 AS-20은 Hafnia alvei와 99%의 염기서열상 동성을 보였다. 이러한 결과는 BioMerieux Vitek Gram negative identification card 키트로 동정한 결과와 일치하였다. AS-20을 $10^{circ}C,;20^{circ}C,;30^{circ}C$에서 배양하면서 $eta-galactosidase$ 활성을 조사한 결과 저온인 $10^{circ}C$와 $20^{circ}C$에서 배양하였을 때에 배양최적... -
발광 박테리아 Photobacterium phosphoreum의 Lumazine Protein을 코드 하는 유전자의 염기 서열 분석 및 발현
우영은, 김소영, 이찬용, Woo. Young-Eun, Kim. So-Young, Lee. Chan-Yong 한국미생물학회 미생물학회지 6 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2005, Vol.41 No.4 306-311 (6 pages)
발광세균 Photobacterium phosphoreum의 lumazine protein을 코드하는 유전자의 염기서열을 결정하였는데, 이 유전자는 lux operon의 656 bp 상류의 영역에 존재하며, lux operon과는 서로 반대 방향으로 전사되는 것으로 나타났다. 중합효소 연쇄 반응(PCR: Polymerase Chain Reaction)의 방법으로 아미노-말단 절반 lumazine protein을 코드하게 되는 유전자(lumP-N)를 클로닝하여 형질전환의 방법으로 대장균에 유전자를 전이시켜 이들의 유전자의 발현 양상을 조사하여 보았는바, lumP 전체 유전자(lumP-W)가 삽입되어 있는 재조합... -
동물용 생 바이러스 백신에서 Mycoplasma 검출을 위한 PCR 기법 적용
전우진, 김병한, 정병열, 안동준, 이철현, 장환, 정갑수, Jeon. Woo-Jin, Kim. Byoung-Han, Jung. Byeong-Yeal, An. Dong-Jun, Yi. Chul-Hyun, Jang. Hwan, Chung. Gab-Soo 한국미생물학회 미생물학회지 6 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2005, Vol.41 No.4 269-274 (6 pages)
바이러스 백신 내에 mycoplasma를 검출하기 위해 polymerase chain reaction (PCR)기법과 2가지의 상품화된 PCR 검출킷트를 평가하였다. PCR기법은 시험에 사용된 모든 mycoplasma를 특이적으로 검출할 수 있었으나, 2가지의 상품화된 PCR 검출킷트는 일부의 mycoplasma를 검출하지 못하였다. 또한, PCR기법의 검출 특이도는 조류 유래 mycoplasma에 속한 4주의 표준주 및 7주의 야외분리주를 모두 검출할 수 있었다. PCR기법의 민감도는 9 CFR Mycoplasma액체배지에서 배양한 Mycoplasma 속균 및 Acholeplasma속균에 대해 $1~100$ colony... -
Corynebacterium glutamicum의 sigH 유전자의 분리 및 기능분석
김태현, 김형준, 박준성, 김연희, 이흥식, Kim. Tae-Hyun, Kim. Hyung-Joon, Park. Joon-Sung, Kim. Younhee, Lee. Heung-Shick 한국미생물학회 미생물학회지 6 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2005, Vol.41 No.2 99-104 (6 pages)
ORF1은 206아미노산으로 구성된 23,218 Dalton의 단백질을 발현하는 것으로 여겨졌고, 유사성 분석결과 ECF-type에 해당되는 RNA polymerase의 sigma factor를 암호화하는 것으로 보여 sigH로 명명하였다. 유전자 sigH의 기능을 밝히기 위해 gene disruption technique을 이용하여 sigH 유전자가 기능을 하지 못하는 돌연변이 균을 제작하였으며 이 균주는 야생형에 비해 성장속도가 저하됨을 관찰하였다. 또한 변이균은 oxidative stress를유발하는 pumbagin둥에 대해서도 민감성을 나타내었다. 이들 결과는, 유사성 분석결과에서도 볼... -
이산화탄소 증가가 습지토양의 탈질세균 군집구조에 미치는 영향
이승훈, 김선영, 강호정, Lee. Seung-Hoon, Kim. Seonyoung, Kang. Hojeong 한국미생물학회 미생물학회지 4 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2004, Vol.40 No.3 244-247 (4 pages)
군집구조의 변화양상을 관찰하였다. 미생물 군집군조 분석은 탈질과정에 관여하는 효소중하나인 nitrite reductase의 유전자인 nirS 유전자를 대상으로 polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) 분석기법을 이용하여 수행하였다. PCR 결과 모든 토양시료에서 nirS 유전자가 검출되었고, RFLP분석을 통해 자연농도의 이산화탄소조건에서 83개, 고농도 조건에서 95개의 phylotype을 획득하여 조성된 습지토양에서 탈질과정이 광범위하게 일어날 수 있음을 확인할 수 있었다. 두 경우 모두 두 종류 (... -
Aniline 분해세균 Delftia sp. JK-2에서 분리된 catechol 2,3-dioxygenase의 특성 및 N-말단 아미노산 서열분석
황선영, 송승열, 오계헌 한국미생물학회 미생물학회지 7 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2003, Vol.39 No.1 1-7 (7 pages)
확인되었다. 이 N-말단 아미노산 서열은 Pseudomonas sp. AW-2와 Coma-monas sp. Js765의 C2,30와 일치하는 것으로 나타났으며, 얻어진 결과를 토대로 primer를 제작하여 polymerase chain reaction (PCR)을 실시하였다. PCR을 통해 얻어진 Delftia sp. JK-2의 C2,30유전자 DNA서열을 분석하여 상동성 조사를 하였다. DNA서열의 상동성 조사는 유추되는 아미노산 서 열로 바꾸어서 실시하였으며,그 결과 Deftia JK-2의 C2,3O는Pseudomonas sp. AW-2의 C2,3O(100%)와 Coma-monas sp. JS76S의 C2,3O(97%)에서 높은 상동성 이 확인되었다. -
출아효모의 세포주기동안 DNA 상해에 의한 발현 유도에 미치는 DPB11 유전자의 영향
선우양일, 임선희, 배호정, 김중현, 김은아, 김승일, 김수현, 박정은, 김재우 한국미생물학회 미생물학회지 7 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2002, Vol.38 No.2 96-102 (7 pages)
반응에 대한것ba11 변이주의 결손을 확인하기 위해서, nPB11 (DNA polymerase B possible subunit)유전자의 과다발현 효과에 대해 조사하고, HU (Hydroxyurea)와 MMS (Methyl methanesulfonate)에 대한 감수성 및 DNA상해 물질에 의한 RNR3 (Ribonulectide reductase) mRNA의 전사 유도를 조사하였다. RNR3 mRNA의 전사는 DNA합성 저해에 의해 발생한 스트레스나 화학물질에 의한 직접적 인 DNA상해 등에 의해 유도되어진다. 그 결과, dpb11-1변이주는 DNA상해 물질에 감수성을 나타내었고, RNR3 mRNA전사유도 또한 야생형 균주에 비해 약... -
Bovine Vira1 Diarrhea Virus를 이용한 포유동물세포 발현벡터의 개발
한국미생물학회 미생물학회지 2002, Vol.38 No.2 86-95 (10 pages)
polymerase를 사용하여 in vitro transcribed full-length viral RNA를 합성하였다. 합성된 viral RNA의 자가복제 여부는 MDBK세포에 transfection시킨 후, $^{32}P$ 로 metabolically label함으로써 확인하였다. 또한, transfection된 세포에서의 바이러스 단백질 발현여부는 바이러스에 특이적으로 반응하는 anti-NS3 단클론항체를 사용하여 분석하였다. 또한, infectious CDNA clone을 응용하여 새로운 포유동물세포유전자 발현벡터의 개발을 위해서, 먼저 바이러스의 구조단백질이 바이러스의 자가복제에 필수적인 지를 평가하였다....


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