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2H-Gel 이미지의 정렬 및 클러스터링
허원, Hur. Won 한국생물공학회 한국생물공학회지 5 Pages
한국생물공학회 한국생물공학회지 2005, Vol.20 No.2 71-75 (5 pages)
2D-Gel 이미지간의 유사성을 기준으로 생물학적인 시료가 프로테옴 수준에서 유사성의 정도와 서로 다른 단백질 스팟을 파악해 낼 수 있다. 그러나 생물학적인 시료는 개체간 변화가 크고 2차원 전기영동장치의 재현성의 한계로 인하여 비교가 어려운 경우가 많고 의미 없는 차이점만 발견되는 경우 또한 비일비재하다. 이를 극복하기 위해서는 프로테옴 이미지간의 정렬을 통하여 정확한 비교가 가능하게 하여야한다. 본 연구에서는 이미지상의 단백질 스팟을 일일이 찾지 않고 여러 개의 원시 이미지를 동시에 정렬시키는... -
Development of Candidate Biomarkers for Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Using Multiple Reaction Monitoring
Yu. Jiyoung, Kim. Kyunggon, Kang. MeeJoo, Kim. Hyunsoo, Kim. Sun Whe, Jang. Jin-Young, Kim. Youngsoo 한국생물공학회 Biotechnology and bioprocess engineering 10 Pages
한국생물공학회 Biotechnology and bioprocess engineering 2013, Vol.18 No.5 1038-1047 (10 pages)
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Identification of Potential Substrates of N-acteylglucosamine Kinase by a Proteomic Approach
이현숙, 문일수, Lee. HyunSook, Moon. Il Soo 한국생명과학회 생명과학회지 9 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2013, Vol.23 No.4 586-594 (9 pages)
단백질 번역 후 O-GlcNAc 수식은 단백질 조절의 새로운 기전으로 대두되고 있다. 전통적인 당수식과 달리 O-GlcNAc 수식은 단 한번의 O-GlcNAc 전달로 이루어지며, 핵 및 세포질단백질 모두에 수식될 수 있다. O-GlcNAc은 이 분자를 끝으로 하는 최종수식으로 생각되어 왔으나, 최근의 논문(J Proteome Res. 2011 10:2725-2733)은 AP180 단백질에 O-GlcNAc-P가 존재함을 보고하였다. 이 논문은 O-GlcNAc-P가 일반적인 단백질수식인지에 대한 중요한 질문을 던진다. 이에 답하고자 저자들은 HEK293T 세포에 O-GlcNAc 인산화효소 NAGK를... -
40℃ 48시간 에탄올발효 과정 중 일어나는 Saccharomyces cerevisiae KNU5377의 생리 변화
곽선혜, 김일섭, 강경희, 이정숙, 진익렬, Kwak. Sun-Hye, Kim. Il-Sup, Kang. Kyung-Hee, Lee. Jung-Sook, Jin. Ingn-Yol 한국생명과학회 생명과학회지 9 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2011, Vol.21 No.1 146-154 (9 pages)
전기영동(2-D)을 통한 세포내 단백질의 발현정도를 proteomics분석법으로 살펴본 바, phosphoglycerate kinase가 가장 크게 발현했음을 Mass Spectrometry를 통해 알 수 있었다. 그 뒤를 이어 adenylate kinase, Cys3p, Tdh3p, translational elongation factor 등이 크게 발현된 것을 알게 되었다. 이들은 직간접적으로 해당과정에 관여하는 인자들 이어서, 고온 장시간에 걸친 에탄올발효를 하는 이 발효 효모균주의 세포에게는 생존과 에탄올발효를 위하여 해당과정 관여 인자가 중요한 역할을 하고 있다는 것을 강력히 시사하였다. -
수경재배 영양결핍토마토에서 브레시노스테로이드관련 신호전달 단백질 BAK1의 동정
신평균, 장안철, 홍성창, 이기상, Shin. Pyung-Gyun, Chang. An-Cheol, Hong. Sung-Chang, Lee. Ki-Sang 한국생명과학회 생명과학회지 5 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2007, Vol.17 No.12 1729-1733 (5 pages)
BAK1(Brassinolide insensitive associated receptor kinase 1)는 브라시노스테로이드 생합성 대사관련 신호전달 매체이다. BR 생합성 및 신호전달 돌연변이체는 매우 특징적인 난쟁이 표현형을 보인다. 과채류전용 양액배지인 Sonneveld 양액을 이용하여 양분결핍에 의해 왜성을 나타내는 토마토를 선발하였다. 선발된 토마토에 대해 이차원 전기영동법으로 단백질체를 분석한 결과, 발현차를 나타내는 28개의 단백질 spot이 분리되었다. 분리된 단백질 spot중 현저하게 발현이 억제된 단백질 spot 6개를 선발하여 단백질 서열을... -
Characterization of Arabidopsis Histidine Kinase 3 and Proteomic Analysis of Its Mutant
양영실, 차준영, 네티 엘마와티, 정민희, 이곤호, 손대영, Liang. Ying-Shi, Cha. Joon-Yung, Ermawati. Netty, Jung. Min-Hee, Lee. Kon-Ho, Son. Dae-Young 한국생명과학회 생명과학회지 7 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2006, Vol.16 No.3 447-453 (7 pages)
Histidine kinase는 식물의 신호전달기작에서 매우 중요한 역할을 한다. 본 연구에서는 애기장대 histidine kinase 3 (AHK3)의 식물체내에서의 기능을 조사하였으며 이 유전자의 결손 돌연변이체인 ahk3에 trans-zeatin (t-zeatin)을 처리하여 유전자와 단백질의 발현양상을 분석하였다. ahk3는 야생형 식물체에 비하여 캘러스 형성, 유모의 성장, 잎의 노화과정에서 t-zeatin에 대한 감수성이 줄어들었다. 프로테옴 분석 결과 eukaryotic translation initiation factor 5A-2, auxin binding glutathione S-transferase, NDPK1 등은... -
Proteome Analysis of Drosophila melanogaster Used 2-DE and MALDI- TOF-MS
박정원, 차재영, 송재영, 김희규, 김범규, 전병삼, Park. Jeong-Won, Cha. Jae-Young, Song. Jae-Young, Kim. Hee-Kyu, Kim. Beom-Kyu, Jeon. Beong-Sam 한국생명과학회 생명과학회지 7 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2005, Vol.15 No.3 427-433 (7 pages)
초파리는 유전학, 발달 생물학, 행동 유전학, 노화 연구에 이르기까지 수많은 연구에 이용 되어져 왔다. 최근 초파리 전체 유전자의 염기서열이 보고되었으며, 유전자의 기능 분석과 발현 단백질에 대한 연구가 진행되고 있다. 본 연구에서는 야생형 초파리에서 추출한 단백질을 이차원 전기영동을 통해 400여개 이상의 단백질 스폿으로 분리하였으며, 각 스폿을 적출하여 트립신으로 처리하여 얻어진 펩타이드 단편을 MALDI-TOF-MS를 이용한 펩타이드 지문 검색으로 질량을 측정하였다. 측정된 질량을 초파리 데이터 베이스를 이용하여... -
생식생물학에세 프로테오믹스의 응용
김호승, 윤용달, Kim. Ho-Seung, Yoon. Yong-Dal 한국발생생물학회 발생과 생식 9 Pages
한국발생생물학회 발생과 생식 2004, Vol.8 No.1 1-9 (9 pages)
프로테오믹스(proteomics, 단백질체학이라고도 함)의 잠재적 중요성은 간질환, 심장질환, 몇몇 종류의 암 등의 의학, 생식 독성, 발생 독성, 생체 독성 연구 분야에서도 명백하게 제시되었다. 그러나 단백질을 대상으로 연구하여 유전자 기능을 연구하는 프로테오믹스 연구를 각각의 분야에 접목시키려는 노력은 아직까지 빈약하다. 프로테오믹스는 기능을 갖는 단백질들의 발현을 종합적이고 정량적으로 측정하는 가장 직접적인 수단이고, 질병, 약물투여, 쇼크, 내분비계 장애물질 등 생물학적인 동요(perturbation)에 의하여 변하는...


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