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개의 대퇴골두인대 절단 모델에서 프로테오믹스로 관찰한 관절액의 변화
김세훈, 신기욱, 지중룡, 심관섭, 김남수, Kim. Se-Hoon, Shin. Ki-Uk, Ji. Joong-Ryong, Shim. Kwan-Seob, Kim. Nam-Soo 한국임상수의학회 Journal of veterinary clinics 7 Pages
한국임상수의학회 Journal of veterinary clinics 2010, Vol.27 No.6 679-685 (7 pages)
10 - 16kg (평균 $11.90{pm}1.68 kg$) 이었다. 실험 기간 동안 방사선검사, 일반혈액검사, 혈청화학검사상 특이사항이 없었다. 실험동물은 술 후 평균 일주일에 보행을 하였다. Proteomic 검사 상, 관절액의 단백질 변화가 보여졌으며 단백질의 변화의 유의성검증을 위해 ANOVA (p < 0.05)테스트를 실시하였다. 실험 결과로는 프로테오믹스 검사에서는2개의 단백질 점(Vitamin D-binding protein precursor, ANOVA (p < 0.004); Kinogen-1, ANOVA (p < 0.039))이 유의성 있게 증가되는 모습이 확인하였다(ANOVA (p < 0.05)).... -
Annexin A5 as a New Potential Biomarker for Cisplatin-Induced Toxicity in Human Kidney Epithelial Cells
Kwon. Yeo-Jung, Jung. Jin-Joo, Park. Na-Hee, Ye. Dong-Jin, Kim. Donghak, Moon. Aree, Chun. Young-Jin 한국응용약물학회 Biomolecules & therapeutics 6 Pages
한국응용약물학회 Biomolecules & therapeutics 2013, Vol.21 No.3 190-195 (6 pages)
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Proteomics-based identification and characterization of biotype-specific carboxylesterase 2 putatively associated with insecticide resistance in Bemisia tabaci
Kang. Soyoung, Lee. Hye Jung, Kim. Young Ho, Kwon. Deok Ho, Oh. Jung Hun, Kim. Bum Jun, Lim. Kook Jin, Lee. Seunghwan, Hwang. Seung Yong 한국응용곤충학회 Journal of Asia-Pacific entomology 8 Pages
한국응용곤충학회 Journal of Asia-Pacific entomology 2012, Vol.15 No.3 389-396 (8 pages)
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칼슘함량이 강화된 새송이 버섯의 프로테옴 분석
배희선, 김대현, 최웅규, Bae. Hee-Sun, Kim. Dae-Hyun, Choi. Ung-Kyu 한국식품과학회 한국식품과학회지 5 Pages
한국식품과학회 한국식품과학회지 2011, Vol.43 No.1 12-16 (5 pages)
본 연구에서는 프로테오믹스 기술을 활용하여 칼슘함량이 증가된 새송이버섯과 일반 새송이 버섯에서 단백질 발현의 변화를 조사하였다. 또한 현저한 차이를 보이는 단백질들을 분리, 동정함으로써 새송이버섯 칼슘강화의 기작규명에 기초자료를 제공하고자 하였다. 새송이버섯의 단백질 패턴을 확인한 결과 15 Kda에서 100 Kda 사이에 존재하는 60% 정도의 spot은 산성 pI를 가지며 나머지 40% 정도의 spot은 염기성 영역에 나타났다. 100 Kda 이상에서는 polypeptide spot이 거의 나타나지 않았다. 그리고 9.0 이상의 pI에서도 spot은... -
단백체 스펙트럼 데이터의 분류를 위한 랜덤 포리스트 기반 특성 선택 알고리즘
온승엽, 지승도, 한미영, Ohn. Syng-Yup, Chi. Seung-Do, Han. Mi-Young 한국시뮬레이션학회 한국시뮬레이션학회논문지 9 Pages
한국시뮬레이션학회 한국시뮬레이션학회논문지 2013, Vol.22 No.4 139-147 (9 pages)
논문에서는 질량 분석 방법에 의하여 산출된 단백체 데이터(mass spectrometric proteomic data)의 분류 분석(classification analysis)을 위한 새로운 특성 선택(feature selection) 방법을 제안한다. 이 방법은 i)높은 상관관계를 가지는 중복된 특성을 효과적으로 제거하는 전처리 단계와 ii)토너먼트(tournament) 전략을 사용하여 최적 특성 부분집합(optimal feature subset)을 탐색해 내는 단계로 구성되어 있다. 제안되는 방법을 실제 암진단에 사용되는 공개된 혈액 단백체 데이터에 적용하였으며 널리 사용되는 타 방법과 비교할... -
생식생물학에세 프로테오믹스의 응용
김호승, 윤용달, Kim. Ho-Seung, Yoon. Yong-Dal 한국발생생물학회 발생과 생식 9 Pages
한국발생생물학회 발생과 생식 2004, Vol.8 No.1 1-9 (9 pages)
프로테오믹스(proteomics, 단백질체학이라고도 함)의 잠재적 중요성은 간질환, 심장질환, 몇몇 종류의 암 등의 의학, 생식 독성, 발생 독성, 생체 독성 연구 분야에서도 명백하게 제시되었다. 그러나 단백질을 대상으로 연구하여 유전자 기능을 연구하는 프로테오믹스 연구를 각각의 분야에 접목시키려는 노력은 아직까지 빈약하다. 프로테오믹스는 기능을 갖는 단백질들의 발현을 종합적이고 정량적으로 측정하는 가장 직접적인 수단이고, 질병, 약물투여, 쇼크, 내분비계 장애물질 등 생물학적인 동요(perturbation)에 의하여 변하는... -
녹차폴리페놀에 노출된 Salmonella typhimurium의 세포반응
최효경, 오계헌, Choi. Hyo-Kyung, Oh. Kye-Heon 한국미생물학회 미생물학회지 6 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2012, Vol.48 No.2 87-92 (6 pages)
이 연구의 목적은 국산 녹차(Camellia sinensis L.)에서 추출한 차폴리페놀(tea polyphenols, TPP)에 노출된 Salmonella typhimurium의 여러 가지 세포반응을 조사하는 것이다. TPP는 S. typhimurium에 대하여 투여량에 비례한 살균효과를 보여주었다. TPP로 처리된 S. typhimurium 배양에서 세포막을 구성하는 포화 및 불포화 지방산은 조성에서 상당한 변화가 일어난 것으로 분석되었으며, 주사전자현미경 분석에서 아치사 농도의 TPP로 처리된 세포는 세포표면에 구멍이 나고, 속이 움푹 패인 불규칙한 모양으로 관찰되었다. TPP에... -
탄저 치사독소 처리에 의한 생쥐 대식세포의 단백질체 발현 양상 분석
정경화, 서귀문, 김성주, 김지천, 오선미, 오광근, 채영규, Jung. Kyoung-Hwa, Seo. Giw-Moon, Kim. Sung-Joo, Kim. Ji-Chon, Oh. Seon-Mi, Oh. Kwang-Geun, Chai. Young-Gyu 한국미생물학회 미생물학회지 7 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2005, Vol.41 No.4 262-268 (7 pages)
탄저 치사독소는 생쥐 대식세포 (RAW 264.7)의 유전자 발현에 많은 변화를 초래한다. 이들 변화를 초래하는 치사독소의 역할은 아직 확실하게 밝혀지지 ???았다. 본 연구에서는, 치사독소가 처리된 생쥐 대식세포의 단백질 프로파일을 이차원 전기영동으로 분석하였고, MALDI-TOF 질량분석기를 사용하여 해당 단백질의 질량을 측정하였다. 펩타이드 질량 분석 데이터는 ProFound 데이터베이스를 이용하여 동정하였다. 차별화되어 발현된 단백질 중에서 절단된 mitogen-activated protein kinase kinase (Mek1)와 glucose-6-phosphate... -
의미하기도 하고 좁은 의미에서는 세포내의 어떤 organelle(예: Golgi Complex)에 존재하는 단백질 혹은 어떤 protein complex를 지칭하기도 한다. Proteomics는 어떤 주어진 조건에서 특별한 세포 또는 organelle에서 발현되는 단백질들을 연구하고 이해하는데 강력한 수단이 되고 있다. 이런 proteomics는 genomics, bioinformatics 등과 유기적으로 연결되어 세포의 기능을 입체적으로 이해하는데 도움을 준다. 본고에서는 proteomic analysis 과정을 간단히 살피고 최근 세포 생물학에서 이루어지는 proteomics의 응용을 살펴본다.