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381.

3 계층의 2.5차원 대사경로 레이아웃 알고리즘

송은하, 용승림, Song. Eun-Ha, Yong. Seunglim 한국컴퓨터정보학회 韓國컴퓨터情報學會論文誌 9 Pages

한국컴퓨터정보학회 韓國컴퓨터情報學會論文誌 2013, Vol.18 No.6 71-79 (9 pages)

송은하, 용승림, Song. Eun-Ha, Yong. Seunglim 저

이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
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화합물의 상호 관계를 그래프를 통해 표현하는 대사 경로는 본질적인 복잡성 때문에 대사 경로 내의 흐름을 한눈에 알 수 있도록 가시화하여 보여 주는 도구가 반드시 필요하다. 또한 유전체 수준의 대사 경로를 연구하기 위해서는 대사 경로 그래프 레이아웃 상에 나타나는 에지 교차를 줄이는 것이 시각화의 매우 중요한 부분이다. 본 논문은 생물학에서의 대사 경로에 대한 시각화를 위한 3-계층을 이용한 대사 경로 레이아웃 알고리즘을 제안한다. 대사경로의 구조적 특징을 고려하여 노드수가 증가하여도 에지 교차가 기하급수적으로...
382.

대사 경로 시각화를 위한 레이아웃 알고리즘 연구

송은하, 용승림, Song. Eun-Ha, Yong. Seunglim 한국컴퓨터정보학회 韓國컴퓨터情報學會論文誌 8 Pages

한국컴퓨터정보학회 韓國컴퓨터情報學會論文誌 2013, Vol.18 No.5 95-102 (8 pages)

송은하, 용승림, Song. Eun-Ha, Yong. Seunglim 저

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생명체 내에서 나타나는 네트워크 중 하나인 대사 경로는 화합물의 상호 관계를 그래프를 통해 표현된다. 대사 경로는 본질적인 복잡성 때문에 대사 경로 내의 흐름을 한 눈에 알 수 있도록 가시화하여 보여 주는 도구가 반드시 필요하다. 이러한 가시화 도구의 경우 노드수가 증가할수록 에지 교차가 기하급수적으로 증가하는 문제가 있다. 따라서 유전체 수준의 대사 경로를 연구하기 위해서는 대사 경로 그래프 레이아웃 상에 나타나는 에지 교차를 줄이는 것이 시각화의 매우 중요한 부분이다. 본 논문은 생물학에서의 대사 경로에...
383.

K-Viz : 대사 경로 비교를 위한 KEGG 기반의 시각화

임동혁, 이동희, 김형주, Im. Dong-Hyuk, Lee. Dong-Hee, Kim. Hyoung-Joo 한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 소프트웨어 및 응용 8 Pages

한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 소프트웨어 및 응용 2007, Vol.34 No.5 389-396 (8 pages)

임동혁, 이동희, 김형주, Im. Dong-Hyuk, Lee. Dong-Hee, Kim. Hyoung-Joo 저

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서로 다른 종에서의 대사 경로를 비교하는 것은 아직 밝혀지지 않은 유전자를 찾는 문제에 있어 매우 중요하다. 많은 대사 경로 시각화가 제시되었지만 생물학자들은 대사 경로를 단순히 보는 것뿐만 아니라 비교하는 시각화를 필요로 한다. K-Viz는 KEGG 기반의 대사 경로를 위한 시각화 툴이다. 다른 종의 대사 경로를 비교하기 위해 KEGG의 PathComp와 같은 경로를 서로 다른 색으로 표현하는 방법과 각 종에서의 경로를 테이블로 보여준다. K-Viz는 생물학자들이 서로 다른 종에서의 대사 경로 비교를 이해하는데 도움을 준다.
384.

바이오패스웨이를 위한 지식 표현 시스템

이민수, 박승수, 강성희 한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 소프트웨어 및 응용 10 Pages

한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 소프트웨어 및 응용 2004, Vol.31 No.3 343-352 (10 pages)

이민수, 박승수, 강성희 저

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최근 생물정보학의 발전과 함께 생물 관련 정보들이 기하급수적으로 증가하고 있다 연구 대상 도 DNA, RNA, 단백질에서 더 나아가 이들의 상호작용 및 조절 메커니즘에 의해 기능들이 어떻게 수행되는 지에 관한 바이오패스웨이까지 포함하게 되었다. 바이오패스웨이는 광대한 양의 정보를 포괄하며 구성체 사이의 유기적 관계를 나타내고 있는 것이므로 이를 컴퓨터로 처리하기 위해서는 보다 명료하며 직관적인 표현이 요구된다. 그러나 기존 시스템에서 사용하는 표기법들은 명료하게 해석될 수 없는 경우가 많고 표현 가능한 영역이...
385.

A Computer-aided Design Tool with Semiautomatic Image-Processing Features for Visualizing Biological Pathways

Ham. Sung-Il, Yang. San-Duk, Thong. Chin-Ting, Park. Hyun-Seok 한국유전체학회 Genomics & informatics 3 Pages

한국유전체학회 Genomics & informatics 2009, Vol.7 No.3 168-170 (3 pages)

Ham. Sung-Il, Yang. San-Duk, Thong. Chin-Ting, Park. Hyun-Seok 저

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386.

Effects of Expression of lcb1/lcb2 and lac1/lag1 Genes on the Biosynthesis of Ceramides

Kim. Se-Kyung, Noh. Yong-Ho, Koo. Ja-Ryong, DaSilva. Nancy A., Yun. Hyun-Shik 한국생물공학회 Biotechnology and bioprocess engineering 6 Pages

한국생물공학회 Biotechnology and bioprocess engineering 2011, Vol.16 No.1 1-6 (6 pages)

Kim. Se-Kyung, Noh. Yong-Ho, Koo. Ja-Ryong, DaSilva. Nancy A., Yun. Hyun-Shik 저

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387.

닭 특이 대사 경로 재확립

김운수, 이세영, 박혜선, 백운기, 이준헌, 서성원, Kim. Woon-Su, Lee. Se-Young, Park. Hye-Sun, Baik. Woon-Kee, Lee. Jun-Heon, Seo. Seong-Won 한국가금학회 한국가금학회지 8 Pages

한국가금학회 한국가금학회지 2010, Vol.37 No.3 275-282 (8 pages)

김운수, 이세영, 박혜선, 백운기, 이준헌, 서성원, Kim. Woon-Su, Lee. Se-Young, Park. Hye-Sun, Baik. Woon-Kee, Lee. Jun-Heon, Seo. Seong-Won 저

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닭 특이 통합 데이터베이스를기반으로PathoLogic 알고리즘을구현한Pathway Tools 소프트웨어를 이용하여 닭 특이 대사 경로를 재확립하였다. 결과적으로, 닭 유전체 Gallus_gallus-2.1에서 2,709개의 효소, 71개의 운반체(transporter)와 1,698개의 효소 반응, 8개의 운반 반응(transport reaction)이 도출되었다. 이를 통해 총 212개의 대사 경로가 재확립되었고, 1,360개의 화합물(compound)이 닭 특이 대사 데이터베이스에 포함되었다. 다른 종(사람, 생쥐, 소)과의 비교 분석을 통해 중요한 대사 경로가 닭 유전체에 보존되어 있음을...
388.

Hesperidin Induces Non-Apoptotic Cell Death in Human HepG2 Cells

Silvia Yumnam, Gyeong Eun Hong, Suchismita Raha, Venu Venkatarame Gowda Saralamma, Ho Jeong Lee, Jeong Doo Heo, Sang Joon Lee, Gon Sup 대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 2 Pages

대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 춘계학술심포지움 138 210-211 (2 pages)

Silvia Yumnam, Gyeong Eun Hong, Suchismita Raha, Venu Venkatarame Gowda Saralamma, Ho Jeong Lee, Jeong Doo Heo, Sang Joon Lee, Gon Sup 저
...
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389.

The Inhibitory Effect of Vibrio vulnificus VvpE on Mucin 2 Expression Via Regulation of ROS Production and Hypermethylation

Eun Ju Song, Sei Jung Lee, Young Hyun Jung, Jung Min Ryu, Ki Hoon Lee, Ing Ing Chai, So Hee Ko, Ji Young Oh, Ho Jae Han 대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 1 Pages

대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 춘계학술심포지움 115 198-198 (1 pages)

Eun Ju Song, Sei Jung Lee, Young Hyun Jung, Jung Min Ryu, Ki Hoon Lee, Ing Ing Chai, So Hee Ko, Ji Young Oh, Ho Jae Han 저
...
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390.

GPAT Expression by Glucosamine-induced O-linked Glycosylation Prevents mESCs from Hypoxia-induced Apoptosis

Hyun Jik Lee, Eun Ju Song, Ki Hoon Lee, Dah Ihm Kim, Jeong Yeon Kim, So Hee Ko, Gee Euhm Choi, Ji Young Oh, Ho Jae Han 대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 2 Pages

대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 춘계학술심포지움 114 197-198 (2 pages)

Hyun Jik Lee, Eun Ju Song, Ki Hoon Lee, Dah Ihm Kim, Jeong Yeon Kim, So Hee Ko, Gee Euhm Choi, Ji Young Oh, Ho Jae Han 저
...
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