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Ampelomyces의 생리적 특성 및 길항능력
김지영, 이왕휴, 김형무 한국식물병리학회 식물병연구 8 Pages
한국식물병리학회 식물병연구 2009, 15권 3호 9 209-216 (8 pages)
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PCR-DGGE 방법을 이용한 북한강 수계 호수의 플랑크톤 군집 분석
김윤정, 김민경, 이상돈 한국습지학회 한국습지학회지 10 Pages
한국습지학회 한국습지학회지 2012, Vol.14 No.3 10 419-428 (10 pages)
식물플랑크톤의 동정은 숙련된 전문가에게도 어려운 과제이다. 별 특징없는 외형과 다양한 크기와 종은 형태학적으로 구분하기에 어려움이 있다. 본 연구에서는 미생물 군집의 다양성을 분석하는데 효과적인 fingerprinting 기법인 PCR-DGGE 방법을 사용하여 이런 형태학적 동정의 제한점을 보완하고자 하는데 목적이 있다. 5곳의 호수 샘플로부터 2008년 8월 총 46개의 band를 찾을 수 있었고, 2008년 11월 총 26개 band를 찾을 수 있었다. 이 fingerprint 결과는 각각 다른 샘플링 장소를 비교하는데 용이하였다. 본 연구에서 PCR-DGGE... -
양식동남아산 뱀장어(Anguilla bicolor pacifica)의 Heterosporis anguillarum 감염
김진도, 도정완, 최혜승, 조혜인, 이남실, 김영대, Kim. Jin-Do, Do. Jeong-Wan, Choi. Hye-Sung, Jo. Hyae-In, Lee. Nam-Sil, Kim. Young-Dae 한국환경생물학회 환경생물 7 Pages
한국환경생물학회 환경생물 2014, Vol.32 No.4 382-388 (7 pages)
근조직내에 수많은 포자와 크고 작은 시스트들이 변형된 근육근섬유 내에 관찰되었다. 병어의 근육 환부를 취하여 PCR을 실시하여 H. anguillarum이 가지는 특정 유전자인 Small subunit ribosomal RNA (SSU-rRNA)를 증폭하였다. 좀 더 정확한 동정을 위해 PCR product를 Cloning 후 Sequencing하여 서열들을 분석한 결과 H. anguillarum의 Small subunit ribosomal RNA (Gene bank accession number: AB623036) 서열과 일치하게 나타남을 확인할 수 있었다. primer 18F과 1537R의 PCR product는 약 1366 bp 길이가 일치하였으며, V1과... -
mRNA 리드 시퀀스 데이터를 이용한 선택 스플라이싱 유형 분석
공진화, 윤지희, 이은주, 이종근, 원정임, Kong. Jin-Hwa, Yoon. Jee-Hee, Lee. Un-Joo, Lee. Jong-Keun, Won. Jung-Im 한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 데이타베이스 8 Pages
한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 데이타베이스 2011, Vol.38 No.6 351-358 (8 pages)
DNA 조각들이 mRNA(messenger RNA)로 전사될 때 유전자의 엑손 영역들이 여러 가지 유형으로 다시 연결되는 과정을 말한다. 선택 스플 라이싱의 유형은 현재 7가지가 알려져 있으며, 이들 유형은 인간의 질병과 매우 밀접한 관련을 가지고 있다. 본 연구에서는 차세대 시퀀싱 기술로 생성된 mRNA 리드 시퀀스 데이터로부터 각 유전자 영역에 대한 선택 스플라이싱 유형을 분류/추출하는 새로운 알고리즘을 제안한다. 제안된 알고리즘에서는 mRNA 리드 시퀀스 데이터를 DNA 시퀀스와 mRNA 트랜스크립트 시퀀스에 동시 매핑하고, 각 엑손... -
벼 흑조위축병 바이러스의 분자생물학적 연구
박종석, 배신철, 김영민, 백융기, 김주곤, 황영수, Park. Jong-Sug, Bae. Shin-Chyul, Kim. Young-Min, Paik. Young-Ki, Kim. Ju-Kon, Hwang. Young-Soo 한국응용생명화학회 한국농화학회지 6 Pages
한국응용생명화학회 한국농화학회지 1994, Vol.37 No.3 148-153 (6 pages)
못하고 있는 흑조위축병(Rice Black-Streaked Dwarf Virus, RBSDV)에 대한 유전정보에 대하여 연구하였다. 매개충인 보독 애멸구를 이용하여 이병주를 생산한 후 바이러스 입자를 순수 분리하여 전기영동한 결과 10개의 band를 확인하였다. RBSDV RNA로부터 역전사 효소를 이용 cDNA를 합성한 후 ${lambda}gt11$에 삽입하여 cDNA library를 만들었다. 이 library에서 6개의 단편을 선발하였으며 그중 한 개의 clone(pRV3)은 hybridization을 통해 RBSDV 게놈 조각 3번 유래인 것을 확인하였다. pRV3의 염기서열을 결정한 결과 2개의 ORF의... -
Characterization of growth hormone-like sequence of loach, Misgurnus mizolepis
김진경, 송영환, Kim. Jin-Kyung, Song. Young-Hwan 한국어병학회 韓國魚病學會誌= Journal of fish pathology 9 Pages
한국어병학회 韓國魚病學會誌= Journal of fish pathology 1994, Vol.7 No.2 95-103 (9 pages)
미꾸라지의 성장호르몬 유전자를 분리하기 위하여 미꾸라지의 cDNA library를 준비하였다. total RNA는 미꾸라지의 뇌하수체로부터 얻었으며 oligo (dT)-coupled magnetic bead를 이용하여 total RNA로부터 mRNA를 순수분리하였다. 정제된 mRNA는 cDNA를 합성하기 위한 기질로 사용하였으며, 합성된 cDNA는 EcoRV/Smal으로 절단된 pBlueKS+ plasmid vector에 삽입하였다. 모든 ligation 반응용액을 E. coli, JM109 균주에 형질전환을 유도하였으며 형질전환 효율을 최대화시키기 위하여 전기천공법을 이용하였다. 얻어진 모든... -
Polymerase Chain Reaction 방법에 의한 Halobacteria gvp 유전자의 역전사 및 증폭
윤병수, 이상섭 한국미생물학회 미생물학회지 4 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 1992, Vol.30 No.6 456-459 (4 pages)
가스포 형성에 관여하는 유전자로, 이들은 그 transcripts 의 분석에 있어 특유의 연약성 때문에 많은 실험상의 문제를 야기시키고 있다. 본 실험은 연약한 mRNA 를 reverse transcriptase 를 사용, DNA 로 바꾸고 이를 다시 PCR(Polymerase Chain Reaction) 방법으로 증폭시킴으로써, 유전자의 연약한 mRNA 를 다시 상보적인 안정한 DNA 로 대치케 하여 RNA 상의 cloning, RNA sequencing 을 용이하게 하였다. 결과는 유전자 gvpD 에서 거의 전 ORF(Open Reading Frame) 의 범위에서 northern hybridization 에서 발견치 못한 transcipts... -
Identification of Differentially Expressed Radiation-induced Genes in Cervix Carcinoma Cells Using Suppression Subtractive Hybridization
김준상, 이영숙, 이증훈, 이웅희, 성은영, 조문준, Kim. Jun-Sang, Lee. Young-Sook, Lee. Jeung Hoon, Lee. Woong-Hee, Seo. Eun Young, Cho. Moon-June 대한방사선종양학회 대한방사선종양학회지 8 Pages
대한방사선종양학회 대한방사선종양학회지 2005, Vol.23 No.1 43-50 (8 pages)
대상 및 방법 : 자궁경부암세포주인 HeLa세포주에 방사선조사 전과 후 총 RNA와 poly $(A)^+$ mRNA를 분리였다. SSH방법으로 forward 및 reverse-subtracted cDNA libraries를 만들었다. 차등 발현된 유전자를 screening하기 위해 reverse Northern blotting (dot blot analysis)을 이용하여 각각의 library에서 88개의 클론을 선택하였고 Nothern blotting으로 확인 후 sequencing하였다. 결과 : screening상 176개 클론 중 forward-subtracted library에서 10개의 유전자가 reverse-subtracted library에서 9개의 유전자가 동정되었다....
