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한국산 꿩의다리속(미나리아재비과)의 cpDNA trnL-F 지역의 분자진화와 유연관계: Indel events의 영향
박성준, 김혁진, 박선주, Park. Seongjun, Kim. Hyuk-Jin, Park. SeonJoo 한국식물분류학회 식물분류학회지 11 Pages
한국식물분류학회 식물분류학회지 2012, Vol.42 No.1 13-23 (11 pages)
본 연구는 한국산 꿩의다리속 내에서 trnL-F 지역의 분자진화와 유연관계를 분석하였다. 갭형질을 이용한 자료의 베이시안과 파시모니 분석에서 몇몇 indels evolution는 분계조를 지지하여 해상력이 좋은 계통수가 나타났다. 한국산 꿩의다리속 내에 cpDNA trnL-F 지역의 indel events는 계통학적으로 유용한 정보를 가지고 있는 것으로 판단된다. 산꿩의다리절(그늘꿩의다리 제외)은 속내에서 가장 먼저 분기한 것으로 나타났고, 나머지 절은 강하게 분계조를 형성하며 분기하였다. 한국산 꿩의다리속 내에 trnL-F 지역은 뉴클레오티드의... -
제주 흑우 집단에서 Indel, Microsatellite 마커와 MC1R 유전자형을 이용한 친자 확인
한상현, 조상래, 조인철, 조원모, 김상금, 양성년, 강용준, 박용상, 김영훈, 박세필, 김은영, 이성수, 고문석, Han. Sang Hyun, Cho. Sang-Rae, Cho. In-Cheol, Cho. Won-Mo, Kim. Sang-Geum, Yang. 한국수정란이식학회 韓國受精卵移植學會誌 7 Pages
한국수정란이식학회 韓國受精卵移植學會誌 2013, Vol.28 No.3 207-213 (7 pages)
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제주흑우, 한우 및 수입 소 품종에서 새로운 indel 마커의 다형성과 대립인자 분포
한상현, 김재환, 조인철, 조상래, 조원모, 김상금, 김유경, 강용준, 박용상, 김영훈, 박세필, 김은영, 이성수, 고문석, Han. Sang-Hyun, Kim. Jae-Hwan, Cho. In-Cheol, Cho. Sang-Rae, Cho. Won-Mo, Kim 한국생명과학회 생명과학회지 7 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2012, Vol.22 No.12 1644-1650 (7 pages)
이용한 소 6 품종은 8 종의 marker들에 대해 다형성을 나타내었으나, Indel_15의 경우 Holstein과 Charolais에서 다형성이 발견되지 않았다. JBC 집단에 대한 분석에서는 관찰된 이형접합자 빈도는 HW_G1 (0.600)에서 가장 높고, Indel_29 (0.274)에서 가장 낮았다. Marker에 대한 다형정보량의 수준은 HW_G4 (0.373)에서 가장 높고, Indel_6 (0.305)에서 가장 낮은 수준을 보였다. 본 연구에서 조사한 새로운 indel marker들은 특히 제주흑우 집단의 생산성 향상을 위한 분자육종 체계의 개발뿐만 아니라 친자확인이나 생산이력추적을... -
Epidemiologic and phylogenetic analysis of the isolated porcine reproductive and respiratory syndrome virus in local swine farms of Korea
Hyeon-jeong Kang, Ji Eun Yu, In Ohk Ouh, Ji Eun Shin, Seung Min Song, In Soo Cho, Sang Ho Cha 대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 2 Pages
대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 추계학술심포지움 103 241-242 (2 pages)
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Determination of SNP primers for genotyping by whole-genome sequence of Mycobacterium bovis strain B-3222 isolated from Korean beef cattle in bTB-infected herd
Yu Sin Ok, Narae Kim, Tae woon Kim, Yunho Jang, Shin Seok Kang, Hyeon Seop Byeon, Suk Chan Jung, Young Hee Lim, Jae Myung Kim 대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 2 Pages
대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 추계학술심포지움 102 240-241 (2 pages)
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Sequence variations of the bovine prion protein gene (PRNP) in native Korean Hanwoo cattle
Sangho Choi, Hee-Jong Woo*, Jeongmin Lee* 대한수의학회 Journal of Veterinary Science 11 Pages
대한수의학회 Journal of Veterinary Science 2012, 제 13권 제 2호 3 127-137 (11 pages)
were completely conserved, and the haplotype frequency of the coding region was similar to that of other B. taurus strains. When we examined the 23-bp and 12-bp insertion/deletion (indel) polymorphisms in the non-coding region of PRNP, Hanwoo cattle had a lower deletion allele and 23-bp del/12-bp del haplotype frequency than healthy and BSE-affected animals of other strains. Thus, Hanwoo are seemingly less susceptible to BSE than other strains due to the 23-bp and 12-bp indel polymorphisms. -
Resistance to Turnip Mosaic Virus in the Family Brassicaceae
Peter Palukaitis, Su Kim 한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 23 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2021, 37권 1호 1 1-23 (23 pages)
Resistance to diseases caused by turnip mosaic virus (TuMV) in crop species of the family Brassicaceae has been studied extensively, especially in members of the genus Brassica. The variation in response observed on resistant and susceptible plants inoculated with different isolates of TuMV is due to a combination of the variation in the plant resistome and the variation in the virus genome. Here, we review the breadth of this variation, both at the level of variation in TuMV sequences, with one... -
De novo Genome Assembly and Single Nucleotide Variations for Soybean Mosaic Virus Using Soybean Seed Transcriptome Data
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 10 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2017, 33권 5호 5 478-487 (10 pages)
Soybean is the most important legume crop in the world. Several diseases in soybean lead to serious yield losses in major soybean-producing countries. Moreover, soybean can be infected by diverse viruses. Recently, we carried out a large-scale screening to identify viruses infecting soybean using available soybean transcriptome data. Of the screened transcriptomes, a soybean transcriptome for soybean seed development analysis contains several virus-associated sequences. In this study, we... -
Molecular Screening of Blast Resistance Genes in Rice using SSR Markers
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 13 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2015, 31권 1호 2 12-24 (13 pages)
Rice Blast is the most devastating disease causing major yield losses in every year worldwide. It had been proved that using resistant rice varieties would be the most effective way to control this disease. Molecular screening and genetic diversities of major rice blast resistance genes were determined in 192 rice germplasm accessions using simple sequence repeat (SSR) markers. The genetic frequencies of the 10 major rice blast resistance genes varied from 19.79% to 54.69%. Seven accessions... -
Mini-Review : Current Insights into Research on Rice stripe virus
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 11 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2013, 29권 3호 1 223-233 (11 pages)
Rice stripe virus (RSV) is one of the most destructive viruses of rice, and greatly reduces rice production in China, Japan, and Korea, where mostly japonica cultivars of rice are grown. RSV is transmitted by the small brown plant-hopper (SBPH) in a persistent and circulative-propagative manner. Several methods have been developed for detection of RSV, which is composed of four single-stranded RNAs that encode seven proteins. Genome sequence data and comparative phylogenetic analysis have been...
