병원 등의 의료시설은 생활배수, 화학배수, RI배수 등 하나의 시설로부터 특성이 다른 여러 가지 종류의 배수가 배출되고 있다는 것이 다른 사업소와는 다른 특징이다. 각각의 배수는 생물적 처리, 배출원 대책, 저류ㆍ감쇠 처리 등 적절한 처리 방법이 다르기 때문에 개별적인 처리대책이 필요하다. 여기에서는 의료시설의 배수 배출원, 배출특성 및 배수처리방법 등에 대하여 서술한다.