Peroxisome proliferator-activated receptor $alpha$ (PPAR$alpha$)에 대한 본격적인 연구는 고지혈증 치료제인 fibrate류의 약물들이 PPAR$alpha$ activator로 작용한다는 사실이 밝혀짐으로써 크게 증대되었다. PPAR$alpha$는 fibrate를 포함한 다양한 종류의 peroxisome proiferator (PP)에 의해 활성화되는데 이들을 쥐에 단기간 투여할 경우 간의 peroxisome수와 지 방산 산화효소의 유전자발현이 증가되고 장기간 투여 할 경우 간암을 발생시키지만, fibrate류의 약물들을 고지혈증 환자에게 투여 할 경우 간암을 발생시키지 않으므로써 PP에 대한 반응성에 있어서 species difference를 나타낸다 PPAR$alpha$는 핵에 존재하는 orphan receptor로서 PP에 의해 활성화되어 9-cis-retinoic acid receptor(RXR)와 heterodimer를 이룬 후 target gene들의 upstream에 있는 peroxisome proliferator response element (PPRE)에 결합하여 target gene들의 발현을 조절한다. 지금까지 연구된 PPAR$alpha$의 target gene들은 모두 lipid와 lipoprotein 대사를 조절하는 것으로 알려져 있으며, 이러 한 결과들을 기초로 lipid 대사 및 energy balance와 관련된 질병들 - 동맥경화증, 관상동맥질환, 비만, 제 2형 당뇨병 등에서 PPAR$alpha$의 역할이 집중적으로 연구되고 있다. PPAR$alpha$가 활성화되면 lipoprotein lipase와 HDL이 증가되고 apo C-III가 감소됨으로써 동맥경화증에 대한 예방적 기능을 나타내고, 몸무게를 감소시킴으로써 비만을 방지할 수 있으며, 인슐린 감수성을 증가시켜 제 2형 당뇨병의 치료효과를 가지는 것으로 보인다. 그러나 PPAR$alpha$-null mouse에서는 이러한 효과들이 나타나지 않는 것으로 보아 이들 질병에서 PPAR$alpha$가 중요한 역할을 하는 것으로 생각된다.