수중음향특화연구센터는 수중 무기체계 개념 도출, 개발 및 운용에 필요한 기초 및 응용기술의 연구를 수행하며 그와 관련된 기반 기술을 확보하는 것이 목적이다. 이러한 목적을 달성하기 위해서는 여러 대학에 산재한 고급인력을 활용, 우수 연구 집단을 형성하여야 될 것이다. 따라서 본 센터는 대학.국방과학연구소.방위산업체 및 관련 연구소를 잇는 고리역할을 충실히 수행하게 될 것이며, 궁극적으로는 국방에 필수 불가결한 수중 무기체계의 국내 자체개발 및 생산에 필요한 기반 기술을 제공할 것이다.