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Solution State Structure of pB1, the Mimotopic Peptide of Apolipoprotein B-100, by NMR
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  • Solution State Structure of pB1, the Mimotopic Peptide of Apolipoprotein B-100, by NMR
  • Solution State Structure of pB1, the Mimotopic Peptide of Apolipoprotein B-100, by NMR
저자명
Lee. Sung-Ran,Kim. Dae-Sung,Kim. Hyo-Joon,Lee. Yong-Woo,Won. Ho-Shik
간행물명
Bulletin of the Korean Chemical Society
권/호정보
2004년|25권 12호|pp.1845-1849 (5 pages)
발행정보
대한화학회
파일정보
정기간행물|ENG|
PDF텍스트
주제분야
기타
이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
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기타언어초록

Apolipoprotein B-100 (Apo-B100) is a major protein component for low density lipoproteins (LDL). A number of mimetic peptides of Apo-B100 were screened from the phase-displayed random peptide library by utilizing monoclonal antibody (B9). Mimetic peptide for B9 epitope against apo B-100 was CRNVPPIFNDVYWIAF (pB1). From the BLAST search, the mimetic peptide pB1 had 40% homology with apo B-100. As a result of the structural determination of this mimotope using homo/hetero nuclear 2D-NMR techniques and NMR-based distance geometry (DG)/molecular dynamic (MD) computations, DG structure had low penalty value of 0.3-0.6 ${AA}^2$ and the total RMSD was 0.5-1.5 ${AA}. Moreover, pB1 structure included a weak $3_{10}$-helix from $Ile^7$, to $Trp^{13}$.