기관회원 [로그인]
소속기관에서 받은 아이디, 비밀번호를 입력해 주세요.
개인회원 [로그인]

비회원 구매시 입력하신 핸드폰번호를 입력해 주세요.
본인 인증 후 구매내역을 확인하실 수 있습니다.

회원가입
서지반출
Microarray Analysis of Gene Expression by Rhei Rhizoma Water Extracts in a Hypoxia Model of Cultured Neurons
[STEP1]서지반출 형식 선택
파일형식
@
서지도구
SNS
기타
[STEP2]서지반출 정보 선택
  • 제목
  • URL
돌아가기
확인
취소
  • Microarray Analysis of Gene Expression by Rhei Rhizoma Water Extracts in a Hypoxia Model of Cultured Neurons
  • Microarray Analysis of Gene Expression by Rhei Rhizoma Water Extracts in a Hypoxia Model of Cultured Neurons
저자명
이현숙,송진영,문일수,Lee. Hyun-Sook,Song. Jin-Young,Moon. Il-Soo
간행물명
생명과학회지
권/호정보
2009년|19권 1호|pp.21-33 (13 pages)
발행정보
한국생명과학회
파일정보
정기간행물|ENG|
PDF텍스트
주제분야
기타
이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
서지반출

영문초록

대황(Rhei Rhizoma; RR, 대황(大黃))은 Rheum officinale Baill.와 Rheum palmatum L.(polygonaceae)의 땅속부분으로 남아시아의 민속의학에서 간 및 신장의 손상을 치료하는데 널리 이용되고 있다. 본 연구에서는 배양한 흰쥐 해마신경세포의 저산소증모델을 이용하여 대황의 물추출물이 유전자 표현에 미치는 영향을 microarray 방법을 이용하여 조사하였다. 배양 후 10일 (DIV10)에 추출물을 배지에 $2.5{mu}g/ml$ 농도로 첨가하고, DIV13에 저산소증(2% $O_2$/5% $CO_2$, $37^{circ}C$, 3 h)을 유발한 후 24 시간 후에 total RNA를 분리하여 microarray에 사용하였다. MA-plot에 의하면 표현이 연화된 대부분의 유전자는 ${pm}2$배 이내로 증감되었다. 이 가운데 Global M 값이 0.2(즉, 15%)보다 더 증가한 유전자는 472종, Global M 값이 -0.2(즉, -15%)보다 더 감소한 유전자는 725종이였다. 세포의 생존과 관련된 유전자 가운데 세포자연사 억제유전자인 Tegt(2.4배), Nfkb1 (2.4배), Veg (1.8배), Ngfr (1.6배) 등이 크게 증가하였으며, 반면에 자연사 촉진유전자인 Bad (-64%), Cstb (-66%)는 감소하였다. 스트레스를 극복하는데 필요한 유전자인 Defb3 (2.7배), Cygb (2.2배), Ahsg (2.18배), Alox5 (2배) 등도 크게 증가하였다. 그리고 세포 성장을 촉진하는 유전자인 Erbb2 (1.84배), Mapk12 (1.8배)도 크게 증가하였다. 따라서 대황의 물추출물은 세포생존에 필요한 유전자를 증가시키고, 세포사를 유도하는 유전자는 감소시킴으로서 저산소층 스트레스에서 신경세포의 사망을 억제하는 것으로 해석된다.

기타언어초록

In this study, we investigated the effect of Rhei Rhizoma (RR; 大黃) water extract on gene expression in a hypoxia model of cultured rat hippocampal neurons. RR water extract $(2.5{mu}g/ml)$ was added to the culture media on day 10 in vitro (DIV10), and a hypoxic shock (2% $O_2$/5% $CO_2$, $37^{circ}C$, 3 h) was given on DIV13. After maintaining the cultures in normoxia for 24 hr, total RNA was isolated and used for microarray analysis. The MA-plot indicated that most genes were up- or downregulated within 2-fold. There were more downregulated genes (725 ea) than upregulated ones (472 ea) when larger than Global M value 0.2 (i.e., >15% increase) or smaller than Global M value -0.2 (i.e., >15% decrease) were considered. Antiapoptosis genes such as Tegt (2.4-fold), Nfkb1 (2.4-fold) Veg (1.8-fold), Ngfr (1.6-fold) were upregulated, while pro-apoptosis genes such as Bad (-64%), Cstb (-66%) were downregulated. Genes for combating environmental stress (stress response genes) such as Defb3 (2.7-fold), Cygb (2.2-fold), Ahsg (2.18-fold), Alox5 (2-fold) were upregulated. Genes for cell proliferation (cell cycle-related genes) such as Erbb2 (1.84-fold), Mapk12 gene (1.8-fold) was upregulated. Therefore, RR water extracts upregulate many pro-survival genes while downregulating many pro-death genes. It is interpreted that these genes, in combination with other regulated genes, can promote neuronal survival in a stress such as hypoxia.