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QUARTET CONSISTENCY COUNT METHOD FOR RECONSTRUCTING PHYLOGENETIC TREES
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  • QUARTET CONSISTENCY COUNT METHOD FOR RECONSTRUCTING PHYLOGENETIC TREES
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저자명
Cho. Jin-Hwan,Joe. Do-Sang,Kim. Young-Rock
간행물명
Communications of the Korean Mathematical Society
권/호정보
2010년|25권 1호|pp.149-160 (12 pages)
발행정보
대한수학회
파일정보
정기간행물|ENG|
PDF텍스트
주제분야
기타
이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
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기타언어초록

Among the distance based algorithms in phylogenetic tree reconstruction, the neighbor-joining algorithm has been a widely used and effective method. We propose a new algorithm which counts the number of consistent quartets for cherry picking with tie breaking. We show that the success rate of the new algorithm is almost equal to that of neighbor-joining. This gives an explanation of the qualitative nature of neighbor-joining and that of dissimilarity maps from DNA sequence data. Moreover, the new algorithm always reconstructs correct trees from quartet consistent dissimilarity maps.