화진포호에서 장기간의 수환경변화를 알아보기 위해 2000년부터 2008년까지 염분, 용존산소, 총인 및 총질소등 이 화학적 조사를 하였으며, 동식물플랑크톤은 2007년과 2008년에 조사하였다. 화진포호에서 2000년부터 2008년까지 조사된 수질자료를 보면 수온, 염분, 투명도, COD 및 DO는 각각 $2.8{sim}29.4^{circ}C$, 0.23~41.8‰, $0.2{sim}2.8;m$, $0.2{sim}20.2;mg;L^{-1}$ 및 $0.1{sim}17.4;mg;L^{-1}$의 범위로 평균은 각각 $18.0^{circ}C$, 15.7‰, 0.7 m, $5.7;mg;L^{-1}$ 및 $8.0;mg;L^{-1}$이었다. Chl.${alpha}$은 $0.3{sim}242.5;{mu}g;L^{-1}$으로 평균 $32.8;{mu}g;L^{-1}$이었다. TP와TN는 각각 $0.024{sim}0.869;mg;L^{-1}$(평균 0.091) 및 $0.240{sim}5.310;mg;L^{-1}$(평균 1.235)의 범위를 보였다. TN/TP 비는 평균 16.4이었다. COD, TP, TN 및 Chl.${alpha}$의 연변화를 보면 COD는 2000년에 $4.83m;mg;L^{-1}$이었으나 2008년에는 $1.80;mg;L^{-1}$로 매년 $0.34;mg;L^{-1}$ 감소를 보였다. TP는 2000년에 $0.07;mg;L^{-1}$이였으나 2008년에는 $0.05;mg;L^{-1}$로 차츰 감소하였다. TN은 2000년에 $1.54;mg;L^{-1}$이었으니 2008년에는 $0.77;mg;L^{-1}$로 매년 $0.09;mg;L^{-1}$ 감소하였다. Chl.${alpha}$은 2000년에 $46.30;{mu}g;L^{-1}$이었으나 2008년에는 $5.78;{mu}g;L^{-1}$로 매년 $4.50;{mu}g;L^{-1}$씩 감소하였다. 화진포호의 Orgnic-N, $NO_3$-N, $NH_3$-N 및 $NO_2$-N의 평균 존재 형태별 구성 비율은 각각 78.9, 7.0, 12.4 및 0.8%로 대부분 유기질소 형태이었다. 부영양화도 지수는 남호와 북호에서 2000년에 각각 67과 63에서 2008년에는 63과 59로 감소하였다. 화진포 남호와 북호에서 2007년과 2008년 조사기간 동안 출현한 식물플랑크톤은 총 56속 69종이었다. 식물 플랑크톤의 현존량은 남호가 북호가 각각 18~21,961 및 $153{sim}10,070;cells;mL^{-1}$의 범위로 남호에서 더 많았으며, 남 북호 모두 2007년 7윌에 최소를 보였다. 우점종은 남호의 경우 2007년 5월에 Asterococcus superbus, 9월에 Lyngbya sp., 11월에 Trachelomonas spp.이었으며, 2008년 7월에는 Anabaena spiroides로 시기에 따라 크게 다른 양상을 보였다. 남호와 북호의 종 다양성 지수는 0.87~1.98 (평균 1.41) 및 0.42~1.47 (평균1.07)로 남 북호 모두 2008년 5월에 높았다. 화진포호에서 출현한 동물플랑크톤은 총 31속 35종이었다. 남호의 우점종은 2007년 5, 7월과 2008년 5, 11월에는 요각류의 유생이었으나, 2007년 9월에는 미동정원생동물, 2008년 8월에는 Brachionus plicatilis이었다. 북호의 우점종은 2007년 7월과 11월에는 지각류인 Asplanchna sp.이었으나 그 이외의 시기에는 요각류의 유생이었다. 동물플랑크톤의 밀도는 남호에서 $80{ imes}10^3{sim}3,902{ imes}10^3ind.;L^{-1}$, 북호에서 $88{ imes}10^3{sim}2,106{ imes}10^3;ind.;L^{-1}$로 남호에서 더 높았다. 종 다양성지수는 남호와 북호가 각각 0.53~0.147 (평균 0.83) 및 0.66~1.46 (평균 1.09)의 범위로 남 북호 모두 2008년 7월에 높았다.