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Solution State Structure of pA1, the Mimotopic Peptide of Apolipoprotein A-I, by NMR Spectroscopy
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  • Solution State Structure of pA1, the Mimotopic Peptide of Apolipoprotein A-I, by NMR Spectroscopy
  • Solution State Structure of pA1, the Mimotopic Peptide of Apolipoprotein A-I, by NMR Spectroscopy
저자명
Kim. Hyo-Joon,Won. Ho-Shik
간행물명
Bulletin of the Korean Chemical Society
권/호정보
2011년|32권 9호|pp.3425-3428 (4 pages)
발행정보
대한화학회
파일정보
정기간행물|ENG|
PDF텍스트
주제분야
기타
이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
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기타언어초록

Apolipoprotein A-I (Apo A-I) is a major component for high density lipoproteins (HDL). A number of mimetic peptides of Apo A-I were screened from the phase-displayed random peptide library by utilizing monoclonal antibodies (A12). Mimetic peptide for A12 epitope against Apo A-I was selected as CPFARLPVEHHDVVGL (pA1). From the BLAST search, the mimetic peptide pA1 had 40% homology with Apo A-I. As a result of the structural determination of this mimotope using homo/hetero nuclear 2D-NMR techniques and NMR-based distance geometry (DG)/molecular dynamic (MD) computations, DG structure had low penalty value of 0.3-0.7 ${AA}^2$ and the total RMSD was 0.6-1.6 ${AA}$. The mimotope pA1 exhibited characteristic conformation including a ${eta}$-turn from Pro[7] to His[11].