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Annotation of Genes Having Candidate Somatic Mutations in Acute Myeloid Leukemia with Whole-Exome Sequencing Using Concept Lattice Analysis
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  • Annotation of Genes Having Candidate Somatic Mutations in Acute Myeloid Leukemia with Whole-Exome Sequencing Using Concept Lattice Analysis
  • Annotation of Genes Having Candidate Somatic Mutations in Acute Myeloid Leukemia with Whole-Exome Sequencing Using Concept Lattice Analysis
저자명
Lee. Kye Hwa,Lim. Jae Hyeun,Kim. Ju Han
간행물명
Genomics & informatics
권/호정보
2013년|11권 1호|pp.38-45 (8 pages)
발행정보
한국유전체학회
파일정보
정기간행물|ENG|
PDF텍스트
주제분야
기타
이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
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기타언어초록

In cancer genome studies, the annotation of newly detected oncogene/tumor suppressor gene candidates is a challenging process. We propose using concept lattice analysis for the annotation and interpretation of genes having candidate somatic mutations in whole-exome sequencing in acute myeloid leukemia (AML). We selected 45 highly mutated genes with whole-exome sequencing in 10 normal matched samples of the AML-M2 subtype. To evaluate these genes, we performed concept lattice analysis and annotated these genes with existing knowledge databases.