본 연구에서는 마이크로웨이브 플라즈마(microwave plasma) 를 이용하여 종자에 감염된 Acidovorax citrulli 11-251의 살균 효과를 확인하였다. 감압처리를 통하여 수박 종자에 A. citrulli 11-251를 인공접종하여 이병 종자를 제작하였으며, Aac Im- munoStrip 및 scanning electron microscope 확인 결과, 종피 및 종자 내부에 1×107/30분 처리한 조건에서 감염되었음을 확 인하였다. 플라즈마 처리는 50 W (3분, 5분, 10분), 80 W (3분, 5 분, 10분), 100 W (3분, 5분, 10분) 조건으로 실험 결과, 인공감염 종자를 플라즈마 처리 시 대조구와 비교해보면 종피의 경우 80 W/10분, 99.56%의 살균 효과를 보였고, 종자 내부는 80 W, 100 W/10분, 100%의 높은 살균 효과를 보였다. 인공접종 종자를 사용하여 플라즈마 살균장치의 종자살균 효과를 확인하였다. 하지만 발아율은 무처리구보다 플라즈마 처리 시 급격히 떨어 지는 것을 확인하였다. 주사전자현미경 관찰 결과, 플라즈마 처 리가 A. citrulli 11-251의 세포막을 파괴하는 것을 확인하였다. 또한, A. citrulli가 접종된 수박 종자를 이용하여 플라즈마 처리 시 살균 및 발아율을 높일 수 있는 최적 조건에 대한 추가 실험이 수행될 예정이다.