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하플로타입 페이징 알고리즘에 관한 조사연구
이홍란, 이제근, 장병탁, 황규백, 신수용, Li. Honglan, Rhee. Je-Keun, Zhang. Byoung-Tak, Hwang. Kyu-Baek, Shin. Soo-Yong 한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 소프트웨어 및 응용 12 Pages
한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 소프트웨어 및 응용 2013, Vol.40 No.11 663-674 (12 pages)
인간 유전체 서열 결정이 가능해 짐에 따라 개인 맞춤형 의학을 위한 개인의 유전적 다형성을 밝히는 연구가 광범위하게 진행되고 있다. 특히 최근 들어 동일 염색체 복수좌위에서의 대립형질을 고려하여 단일염기다형성에 기반한 유전체 서열 하플로타입(haplotype)을 생성하는 하플로타입 페이징(phasing) 분석이 주목을 받고 있다. 기존에는 주로 작은 범위 내에서의 하플로타입 페이징 연구가 수행되었으나, 최근 차세대 시퀀싱 기술의 급격한 비용 하락으로 인해 유전체 전체를 대상으로 한 페이징 연구도 시도되고 있다. 본... -
개와 고양이 유래 피부사상균의 분자생물학적 계통 분석
김두, 정석영, 안소저, Kim. Doo, Jeoung. Seok-Young, Ahn. So-Jeo 한국임상수의학회 Journal of veterinary clinics 6 Pages
한국임상수의학회 Journal of veterinary clinics 2006, Vol.23 No.4 405-410 (6 pages)
1 (ITS1) gene을 PCA로 증폭한 후 sequencing을 실시하여, 각 사상균의 계통학적 관계를 조사하였다. M canis 분리주 9주의 ITS1 gene의 nucleotide sequence는 100% 일치하였으며 M gypseum 분리주 5주의 nucleotide sequence도 100% 일치하였다. M canis 분리주 9주의 계통분석 결과 미국, 일본, 호주 및 유럽에서 분리된 M canis와 같은 cluster에 속하였으며 다른 Microsporum spp와는 유전적으로 다른 cluster를 형성하였다. 그러나 M canis와 M distortum, M equinum, M ferrugineum은 유전적으로 매우 가까운 위치에 있었다. M... -
Effects of Somatic Mutations Are Associated with SNP in the Progression of Individual Acute Myeloid Leukemia Patient: The Two-Hit Theory Explains Inherited Predisposition to Pathogenesis
Park. Soyoung, Koh. Youngil, Yoon. Sung-Soo 한국유전체학회 Genomics & informatics 4 Pages
한국유전체학회 Genomics & informatics 2013, Vol.11 No.1 34-37 (4 pages)
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미토콘드리아 ribosomal RNA 유전자 염기서열분석에 의한 한국산 연어아과 어류의 유전적 계통도
이희정, 박중연, 이정호, 민광식, 전임기, 유미애, 이원호, LEE. Heui-Jung, PARK. Jung-Youn, LEE. Jeong-Ho, MIN. Kwang-Sik, JEON. Im Gi, YOO. Mi-Ae, LEE. Won-Ho 한국수산학회 한국수산학회지: Bulletin of the Korean Fisheries Society 7 Pages
한국수산학회 한국수산학회지: Bulletin of the Korean Fisheries Society 2000, Vol.33 No.2 103-109 (7 pages)
2531 bases의 염기서열을 PCR/direct sequencing하여 얻었는데, 모든 염기변이중 전이가 월등히 우세하게 나타났으며, 종내${cdot}$종간변이율은 모두 $0.5{\%}$이하로 낮게 나타나, 다른 영역에 비해 rRNA 유전자 영역에서의 염기서열이 매우 보존적임을 보여주었다. 또한, 미토콘드리아 rRNA 유전자 염기서열은 연어류의 속 (genus)단계 이상에서 집단분류표지인자로 유용하게 쓰일 수 있으리라 사료되어진다. 미토콘드리아 rRNA 염기서열자료를 기초로 구성된 phylogenetic tree를 통해 이들 종간의 진화적인 유연관계를 살펴본 결과,... -
치마버섯 Mating Locus(Y-region)의 비교분석에 관한 연구
이인선, 박동철 한국생명과학회 생명과학회지 9 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2002, Vol.12 No.2 173-181 (9 pages)
sequencing을 행하고 이에 대한 비교분석을 실시하였다. 그 결과 blast program을 사용한 전체 nucleotide 염기서열의 homology비교분석에서 남미산 1-71에 패하여 약 96%의 높은 homology를 나타내었으며, 1-71 A $alpha$ 3 mating locus에서 모두 7개로 추정되는 exon의 염기서열의 비교실험에서도 거의 96% 이상에 이르는 homology를 나타내었다. 부분적으로는 AR (acidic rich region)에서 약 97%, HD (homeodomain)에서는 약 99%, BR (basic rich region)에서 약 97%, 그리고 Ser (serine rich regon)에서 약 95%의 높은 homology를... -
Nocardioides sp. J-326TK의 Adenosine Deaminase Gene에 관한 연구
전홍기, 백형석, 정춘식 한국생명과학회 생명과학회지 8 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 1998, Vol.8 No.6 673-680 (8 pages)
PCR reaction을 행하였다. Genomic DNA를 cloning시킨 pKSN60은 5kb정도의 DNA를 포함하고 있으며 sourthern hybridization 등의 여러 확인 실험을 통하여 adenosine deaminase gene을 포함하고 있다는 알았다. PCR product를 cloning시켜 형성된 recombinant plasmid를 PCR reaction의 primer로서 pTBN20를 sequencing을 행하였다. 그 결과를 다른 ade-nosine deaminase gene의 서열과 비교를 하였는데 미생물인 E. coli와는 nucleotide sequence는 99.5%, amino acid sequence는 98.9%의 homology를 나타내고 human과는 각각 59.5%,... -
리블로스 1,5- 이인산 탄산화효소 유전자의 분리 및 특성규명
박성순, 김희진, 김정호, 김한집, 이종섭, 이광응, 최양도, Park. Sung-Soon, Kim. Hee-Jin, Kim. Chung-Ho, Kim. Han-Jip, Lee. Jong-Seob, Lee. Kwang-Woong, Choi. Yang-D 한국응용생명화학회 한국농화학회지 9 Pages
한국응용생명화학회 한국농화학회지 1994, Vol.37 No.5 361-369 (9 pages)
Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase small subunit(rbcS)의 광유도 발현과 엽록체로의 단백질 이동 메카니즘을 연구하기 위해 벼의 게놈으로부터 rbcS 유전자를 분리하여(GrbcS) 그의 염기서열을 결정하였다. GrbcS의 유전자 염기서열 결정 결과, 단백질 암호부위는 한 개의 intron과 두 개의 exon으로 이루어져 있고 이들은 47개의 transit peptide를 포함하는 175개의 아미노산을 암호화하는 것으로 밝혀졌다. GrbcS의 이러한 구조적인 성질은 다른 단자엽 식물의 그것과 비교적 일치하고 genomic Southern blot analysis 결과 rbcS... -
비소세포폐암에서 p53유전자의 구조적 이상 및 단백질 발현이 예후에 미치는 영향
이이형, 신동환, 김주항, 임호영, 정경영, 양우익, 김세규, 장준, 노재경, 김성규, 이원영, 김병수, 김병수, Lee. Y.H., Shin. D.H., Kim. J.H., Lim. H.Y., Chung. K.Y., Yang. W.I., Kim. S.K., Cha 대한결핵및호흡기학회 결핵 및 호흡기 질환 15 Pages
대한결핵및호흡기학회 결핵 및 호흡기 질환 1994, Vol.41 No.4 339-353 (15 pages)
연구배경 : p53 유전자는 염색체 17p에 존재하는 종양억제유전자인데, 돌연변이가 있는 경우의 mutant protein은 그 반감기가 4~8시간으로 wild type protein의 반감기 6~20분에 비하여 현저한 증가를 보이게 된다. 결과적으로 돌연변이가 있는 경우 p53 단백질이 과축적되어 과발현이 유발되는데, 이러한 기전을 이용하여 p53 면역조직화학염색은 p53유전자의 돌연변이의 검색 방법으로 많이 이용되고 있다. 유방암에서는 p53 핵단백질의 과발현이 있는 경우에 없을 때보다 무병생존기간 및 전체 생존기간 모두에서 유의하게 나쁜 임상... -
GPS Collars of Cloven-Hoofed Livestock Movement Patterns and Prevention of Foot and Mouth Disease in Eastern Mongolia
Suvd Erdene Tseren Ochir, Oun Kyong Moon, Woo seog Jeong, Hac hung Yoon, Jida Choi, Yong Myong Kang, Erdene Ochir Tseren Ochir, Ganzori 대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 2 Pages
대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 추계학술심포지움 174 426-427 (2 pages)
